聚合物基質色譜柱在色譜法中存在兩相，一相是牢固不動的，咱們把它叫做牢固相 另外一相則不竭流過牢固相，咱們把它叫做活動相。色譜法的分手原理便是操縱待分手的各類物資在兩相中的分派系數、吸附本領等親和本領的分歧來進行分手的。使用外力使含有樣品的活動相(氣體、液體)經由過程一牢固于柱中或平板上、與活動互相不相溶的牢固相概況。聚合物基質色譜柱當活動相中照顧的夾雜物流經牢固相時，夾雜物中的各組分與牢固相產生互相感化。因為夾雜物中各組分在性子和布局上的差別，與牢固相之間發生的感化力的巨細、強弱分歧，跟著活動相的挪動，夾雜物在兩相間顛末反復屢次的分派均衡，使得各組分被牢固相保存的時間分歧，從而按必定次序由牢固相中前后流出。聚合物基質色譜柱與得當的柱后檢測法子連系，完成夾雜物中各組分的分手與檢測。
　　聚合物基質色譜柱的離子源、質量分析器和檢測器必須在高真空狀態下工作，以減少本底的干擾，避免發生不必要的離子-分子反應。所以質譜反應屬于單分子分解反應。利用這個特點，我們用液質聯用的軟電離方式可以得到化合物的準分子離子，從而得到分子量。聚合物基質色譜柱由機械真空泵(前極低真空泵)，擴散泵或分子泵(高真空泵)組成真空機組，抽取離子源和分析器部分的真空。只有在足夠高的真空下，離子才能從離子源到達接收器，真空度不夠則靈敏度低。
　　聚合物基質色譜柱是操縱物資的沸點、極性及吸附性子的差別來完成夾雜物的分手，其進程如圖氣相闡發流程圖所示。待闡發樣品在汽化室汽化后被惰性氣體(即載氣，也叫活動相)帶入聚合物基質色譜柱，柱內含有液體或固體活動相，因為樣品中各組分的沸點、極性或吸附機能分歧，每種組分都偏向于在活動相和牢固相之間構成分派或吸附均衡。但因為載氣是活動的，這類均衡實際上很難創建起來。也恰是因為載氣的活動，使樣品組分在活動中進行反復屢次的分派或吸附/解吸附，聚合物基質色譜柱結果是在載氣中濃度大的組分先流超卓譜柱，而在牢固相平分配濃度大的組分后流出。當組分流超卓譜柱后，當即進入檢測器。檢測器能夠將樣品組分的與否變化為電旌旗燈號，而電旌旗燈號的巨細與被測組分的量或濃度成反比。當將這些旌旗燈號放大并記實上去時，便是氣相色譜圖了。
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