利用微波能穿透被加工藥品的熱效應和非熱效應，可分別對各類含水食品藥材藥丸（藥片）進行加熱、干燥、脫水、解凍與滅菌。微波處理具有下列優點： 
? 加熱迅速。傳統的加熱方法是利用物質的傳熱系數，從外到內進行熱量傳遞，而微波則對含水物質內外同時作用。因此加熱均勻迅速，節省能源與處理時間。 
? 由于微波加熱迅速，食物內的營養、葉綠素、維生素可獲得更良好的保存。同時，肌漿含量和肌纖維含量的變化也輕微，脂肪含量相對的減少。 
? 由于微波能穿透一定厚度的物質進行處理，微波干燥、脫水的效率是傳統方法的幾倍至幾十倍。與此同時，它不破壞物質原有的營養成分、色澤和風味。 
? 微波處理物質的同時也對物質進行滅菌防霉。利用微波的非熱效應（生物效應），可在相對低溫下，對物質進行迅速的滅菌處理，大大延長物質的保存期和減少對防腐劑的依賴。