冷庫制冷系統的選擇主要是冷庫壓縮機與蒸發器的選用。一般情況下，小型冷庫選用全封閉壓縮機為主。因全封閉壓縮機功率小，價格相對便宜；中型冷庫一般選用半封閉壓縮機為主；大型冷庫選用半封閉壓縮機，在選用時，也可考慮選用氨制冷壓縮機，因為氨制冷壓縮機功率大，并可一機多用，但冷庫安裝及管理比較復雜。在蒸發器的選用時，高溫冷庫以選用冷風機為蒸發器，其特點是降溫速度快，但易造成冷藏品的水分損耗；中、低溫冷庫選用無縫鋼管制作的蒸發排管為主，其特點是恒溫效果好，并能適時蓄冷。