土壤肥力是苗圃功能持續發揮作用關鍵的因素。在育苗生產中，隨著育苗年限的增加，苗圃土壤肥力下降的現象十分普遍。金葉女貞苗木基地根據多年育苗生產和苗圃土壤管理的實踐，總結出如下保持苗圃土壤肥力的幾個措施。 
中耕要選擇合適的耕作時間，土壤濕度過大時，中耕會破壞土壤結構，耕作后的土壤的空隙度、滲透度和通氣狀況都明顯惡化，對苗木生長構成不良影響，一般作為土壤含水量超過凋萎含水量，并低于田間持水量的70%時，適合耕作，重壤土不超過37%，輕壤土不超過30%，沙壤土不超過22%，土壤過濕嚴禁耕作。 
耕作措施是育苗的重要環節，合理耕作能改良土壤理化性質。合理耕化可增大土壤孔隙度，增強土壤通氣性，有利于根系呼吸和養分吸收。土壤中空氣增多，還易于提高地溫，減少晝夜溫差，促進土壤微生物活力，加快有機物質分解。合理耕作還能改良土壤結構，加強土壤的透水性和蓄水保墑能力，在一定程度上還能消滅雜草和病蟲害。 
輪作是在苗木出圃后，種植一年農作物或培育與前茬苗木不同種類苗木，農作物一般以種植黃豆、綠豆等豆科作物為好。秋季作物收獲后，結合施基肥進行耕耙，整平耙細，第二年春季進行育苗生產。苗木換茬一般有針葉樹種與闊葉樹種交替、深根樹種與淺根樹種交替、培育小苗與培育大苗交替等幾種形式。