關于保稅區轉廠的案例分析如下：東莞的A公司和深圳的B公司都是來料加工廠，A公司生產的成品如電阻要賣給B公司作電子秤配件，以往辦理這種跨關區的"轉廠"，手續很煩瑣。現在他們選擇了保稅倉庫后一切都變得簡單了：A公司辦理東莞至福保的一般貿易清關或者轉關出口交貨至保稅倉庫視同出境，再用B公司的進口手冊在保稅區報進口關辦理貨物的進口手續，貨物的運輸可由國內車輛完成.
解析:1采用國內運輸而非香港轉廠，大大節省運輸成本，運輸時間。
2，A企業同B企業商品編碼不符，無法轉廠，但通過保稅區可以調整商品編碼
3如果B企業只申請了一本進料手冊，手冊有它用，貨品不是急需要，東莞的A公司已出口到保稅倉庫的貨品可以暫存在保稅區倉庫，保稅區倉庫暫時做臨時倉庫。
4對于東莞的A公司不緊緊能提早退稅，按客戶交期交貨，B企業也可以暫緩手冊繁忙所帶來的麻煩. 
一、轉廠含義企業間其中一個企業的加工成品是另一個企業的成品的加工電子秤配件，雙方持各自的加工手冊，分別填報出口和進口報關單在海關辦理進出口手續，這種一出一進的結轉情形稱為“轉廠”。
二、轉廠形式分兩種:1，加工貿易企業之間的轉廠，即深加工結轉
2，一般貿易企業與加工貿易企業的轉廠，即保稅區轉廠說明:如果貴公司是國內一般貿易企業(包括有進出口或無進出口權)需要轉移貨品到加工貿易企業(包括進料加工或來料加工)，就需要用保稅區轉廠來完成. 
三、保稅區轉廠特點總結：1對于加工貿易企業利用保稅區轉廠可以達到退稅目的，而且可以解決報關商品編碼及商品名稱資料不符的問題。
2保稅區轉廠可以讓一般貿易企業與加工貿易企業轉廠，有進出口權的企業在保稅區辦理正常出口而且達到退稅的目的，沒有進口權的企業可以買單出口。
3保稅區轉廠代替香港轉廠，節約運輸成本。

4效率快：進出保稅物流園區以及手續辦理只需半天的時間。