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廣州貫善生物科技有限公司

主營:高通量測序,蛋白質(zhì)組學(xué),分子生物學(xué)
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[供應(yīng)]RNASeq
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  • 產(chǎn)品產(chǎn)地:廣東廣州
  • 產(chǎn)品品牌:貫善生物
  • 包裝規(guī)格:SATXAM2016
  • 產(chǎn)品數(shù)量:1000000
  • 計(jì)量單位:個(gè)
  • 產(chǎn)品單價(jià):7500
  • 更新日期:2016-06-11 09:19:50
  • 有效期至:2017-06-11
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RNASeq 詳細(xì)信息

有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組測序


    轉(zhuǎn)錄組測序的研究對象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和。轉(zhuǎn)錄組測序能夠從整體水平研究基因功能以及基因結(jié)構(gòu),揭示特定生物學(xué)過程中的分子機(jī)理;目前已廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷、藥物研發(fā)和分子育種等領(lǐng)域。

    有參轉(zhuǎn)錄組測序目標(biāo):

        1. 獲得全面轉(zhuǎn)錄本信息;

        2. 檢測稀有轉(zhuǎn)錄本和發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本;

        3. 精確識別可變剪切位點(diǎn),以及不同轉(zhuǎn)錄本之間的單堿基差異。


    一、技術(shù)流程

    二、生物信息分析內(nèi)容

        1. 測序質(zhì)量分析與統(tǒng)計(jì)、評估;

        2. 參考基因組比對;

        3. 新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測;

        4. 基因表達(dá)定量分析、基因表達(dá)水平分析;

        5. 差異基因表達(dá)分析、差異表達(dá)基因GO富集分析和Pathway富集分析;

        6. SNP和Indel分析;

        7. 可變剪切分析;

        8. DEU分析。


    三、結(jié)果展示

        1.數(shù)據(jù)庫使用

數(shù)據(jù)庫

網(wǎng)頁鏈接

基因表達(dá)量分析

www-huber.embl.de/users/anders/HTSeq

KEGG Pathway

kegg.jp  

        2.版圖展示

 

        如圖1.1所示,符合差異表達(dá)條件的基因在圖上以藍(lán)色圓點(diǎn)表示;

圖1.1 火山圖

  

    四、樣本要求

        總量:〉4 μg RNA;濃度:〉50 ng/μL;260/280:〉2.0

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