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廣州貫善生物科技有限公司

主營:高通量測序,蛋白質組學,分子生物學
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[供應]宏基因組測序
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  • 產品產地:廣東廣州
  • 產品品牌:貫善生物
  • 包裝規格:SATXAM2016
  • 產品數量:1000000
  • 計量單位:個
  • 產品單價:9000
  • 更新日期:2016-06-13 08:53:42
  • 有效期至:2017-06-13
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宏基因組測序 詳細信息

宏基因組測序

 

    宏基因組測序對環境樣本所有微生物基因組DNA進行提取和高通量測序,分析樣本環境中所有微生物基因組信息。宏基因組測序解讀微生物群體的多樣性與豐度信息,分析微生物群體基因組及功能,也探求微生物與環境、微生物與宿主之間的關系,發掘和研究新的功能基因。

 

    一、技術流程

 

    二、生物信息分析內容

        1. 測序質量分析與統計、評估

        2.數據庫比對;

        3. 物種豐度分析;

        4. 功能基因注釋;

        5. 基因功能豐度差異分析;

        6. Pathway富集分析;

        7.豐度差異基因/物種聚類分析

        8. PCA分析

 

    三、結果展示

        1.數據庫使用

數據庫

網頁鏈接

NCBI NR

ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db

KEGG Pathway

kegg.jp

 

        2.版圖展示

        

        圖1.1所示,PCA分析有效展示樣本間的關系

圖1.1 PCA

 

    四、樣本要求

        總量:〉5 μg gDNA;濃度:〉100 ng/μL;260/280:〉1.8

 

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