一.Pulldown的概念
       在Pulldown實(shí)驗(yàn)中,帶標(biāo)簽的誘餌蛋白能被特異結(jié)合該標(biāo)簽的固相親和配基捕獲,形成“次級(jí)親和支持物”,用于純化與誘餌蛋白相互作用的其他蛋白。純化產(chǎn)物洗脫后,經(jīng)Westernblot驗(yàn)證或LC-MS/MS,即可證明或鑒定與誘餌蛋白互作的蛋白。
二.Pulldown實(shí)驗(yàn)流程
                                                                          圖1.Pulldown流程示意圖
三.Pulldown實(shí)驗(yàn)方案設(shè)計(jì)
1、構(gòu)建含His或GST標(biāo)簽的誘餌蛋白原核表達(dá)載體;
2、原核表達(dá)誘餌蛋白(我們采用自誘導(dǎo)培養(yǎng)基培養(yǎng)細(xì)菌,能有效降低包涵體的形成);
3、細(xì)菌裂解液過(guò)柱,帶標(biāo)簽的誘餌蛋白被固相化親和配基捕獲,產(chǎn)生“次級(jí)親和支持物”;
4、待測(cè)樣品裂解液過(guò)柱孵育,與誘餌蛋白互作的蛋白被“次級(jí)親和支持物”吸附;
5、清洗,離心,去除未結(jié)合的雜蛋白;
6、洗脫,得到誘餌蛋白及其互作蛋白的復(fù)合物;
7、如要驗(yàn)證某蛋白X與誘餌蛋白互作,則將6.所得的蛋白復(fù)合物與X蛋白的抗體孵育,做Westernblot驗(yàn)證即可;
8、如要尋找誘餌蛋白可能的互作蛋白,則需將6.所得的蛋白復(fù)合物做LC-MS/MS鑒定;
圖2.Pulldown實(shí)驗(yàn)流程圖
四.生物信息學(xué)分析GO注釋統(tǒng)計(jì)
 
                                                    
 Pathway分析
五.Pulldown實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)內(nèi)容
1、原核表達(dá)載體構(gòu)建;
2、融合蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)與純化;
3、pulldown捕獲互作蛋白;
4、Westernblot驗(yàn)證或LC-MS/MS鑒定互作蛋白;
5、數(shù)據(jù)檢索、生物信息學(xué)分析;
6、結(jié)果分析與報(bào)告整理。
 
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